Первым супругом актрисы стал бизнесмен Александр Пляцев, с которым она впервые встретилась в начале нулевых. Он подошел к актрисе после одного из ее спектаклей, подарил ей букет и так и началось их знакомство. Избранник был на двенадцать лет старше актрисы, но это не помешало их общению. Позже в СМИ писали, что на момент встречи с Подкаминской Пляцев был женат и в браке у него было двое детей. Семью он оставил и сыграл свадьбу с Еленой. Елена родила от него дочь Полину.
Их союз не прошел проверку славой: когда Подкаминская начала сниматься в сериале «Кухня», она стала мегазвездой — ей начали предлагать рекламные контракты, роли в новых проектах и участие в фотосессиях. Артистка не могла отказаться от всенародной популярности, которую так долго ждала. Александр же ревновал любимую и к работе, и к коллегам, и к поклонникам.
И действительно, в тот период пошли слухи о романе Подкаминской и ее партнере по «Кухне» Марке Богатыреве. По сюжету сериала их герои обручились и у них даже появилась дочь, но в жизни все было куда прозичнее: Марк и Елена недолго встречались, и, совпадение или нет, но именно в этот период актриса развелась с Пляцевым. Богатырев испытывал к артистке более сильные чувства: публиковал ее снимки в своих соцсетях, подружился с ее дочерью Полиной, а позже и вовсе признался в чувствах.
«Лена — прекрасная женщина и талантливая актриса. У актеров случается, что отношения партнеров в кино перетекают в реальную жизнь. Была влюбленность, с моей стороны — просто огромная. Но эта история касается только нас, — подчеркивал Богатырев. — Скажу одно: сейчас мы находимся в замечательных дружеских отношениях. Нормально общаемся, можем пошутить, посмеяться», — говорил он. Подкаминская же их связь никак не комментировала и, напротив, всегда уверяла публику, что встречаться с актером для нее табу.
В 2017 году знаменитость вышла замуж за Дениса Гущина — руководителя строительной фирмы. Они познакомились, когда Подкаминская искала рабочих для ремонта в своей квартире. В этом браке родились двое детей — дочь Ева и сын Саша. Денис тоже разведен, и у нее от первого брака тоже осталась дочь. Несмотря на востребованность в кино, Елена старается выделять время и для близких.
Любые откровения о личном на широкую аудиторию для меня всегда сомнительны. Даже не подписана на мужа в соцсетях, чтобы не привлекать внимание.
«В своем родительстве мы дошли до такой грани, когда просто побыть вдвоем с мужем — уже огромное счастье: вместе смеяться, вместе идти в обнимку, даже просто вдвоем прокатиться в машине — уже приключение. Для нас сегодня это самое гармоничное и идеальное состояние», — говорила она в интервью «Новому очагу».
